При употреблении пыльцы могут наблюдаться аллергические реакции. Это проявляется зудом кожи, крапивницей, аллергическим насморком, головной болью и другим расстройством здоровья. При назначении пыльцы врач должен спросить у пациента, не было ли аллергической реакции на мед, прополис или другие продукты пчеловодства.
Не следует также назначать пыльцу в сочетании с медом при сахарном диабете.